Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CaluO35887 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CaluO35887 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CaluO35887 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CaluO35887 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CaluO35887 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CaluO35887 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CaluO35887 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CaluO35887 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CaluO35887 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CaluO35887 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CaluO35887 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CaluO35887 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CaluO35887 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CaluO35887 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CaluO35887 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CaluO35887 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CaluO35887 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CaluO35887 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CaluO35887 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CaluO35887 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CaluO35887 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CaluO35887 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CaluO35887 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CaluO35887 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CaluO35887 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CaluO35887 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CaluO35887 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CaluO35887 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CaluO35887 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CaluO35887 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CaluO35887 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CaluO35887 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CaluO35887 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CaluO35887 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CaluO35887 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CaluO35887 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CaluO35887 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CaluO35887 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CaluO35887 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CaluO35887 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CaluO35887 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CaluO35887 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CaluO35887 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CaluO35887 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CaluO35887 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CaluO35887 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CaluO35887 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CaluO35887 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CaluO35887 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CaluO35887 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CaluO35887 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CaluO35887 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CaluO35887 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CaluO35887 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CaluO35887 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CaluO35887 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CaluO35887 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CaluO35887 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CaluO35887 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CaluO35887 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CaluO35887 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CaluO35887 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CaluO35887 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CaluO35887 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CaluO35887 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CaluO35887 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CaluO35887 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CaluO35887 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CaluO35887 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CaluO35887 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CaluO35887 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CaluO35887 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CaluO35887 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CaluO35887 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CaluO35887 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CaluO35887 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CaluO35887 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CaluO35887 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CaluO35887 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CaluO35887 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CaluO35887 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CaluO35887 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CaluO35887 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CaluO35887 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CaluO35887 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CaluO35887 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CaluO35887 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CaluO35887 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CaluO35887 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CaluO35887 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CaluO35887 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CaluO35887 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CaluO35887 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CaluO35887 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CaluO35887 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CaluO35887 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CaluO35887 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CaluO35887 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CaluO35887 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms