Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf18O35714 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms