Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Edil3O35474 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edil3O35474 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edil3O35474 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edil3O35474 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edil3O35474 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Edil3O35474 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Edil3O35474 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Edil3O35474 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Edil3O35474 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edil3O35474 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edil3O35474 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Edil3O35474 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edil3O35474 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edil3O35474 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edil3O35474 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edil3O35474 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edil3O35474 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edil3O35474 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edil3O35474 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edil3O35474 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Edil3O35474 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Edil3O35474 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Edil3O35474 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Edil3O35474 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edil3O35474 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edil3O35474 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edil3O35474 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edil3O35474 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Edil3O35474 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edil3O35474 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edil3O35474 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edil3O35474 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edil3O35474 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms