Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt1O35449 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt1O35449 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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