Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad6O35182 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad6O35182 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad6O35182 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Smad6O35182 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad6O35182 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad6O35182 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smad6O35182 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smad6O35182 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smad6O35182 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad6O35182 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smad6O35182 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smad6O35182 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smad6O35182 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad6O35182 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad6O35182 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms