Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casq1O09165 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Casq1O09165 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Casq1O09165 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Casq1O09165 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Casq1O09165 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casq1O09165 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Casq1O09165 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casq1O09165 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms