Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Snap23O09044 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Snap23O09044 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Snap23O09044 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Snap23O09044 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Snap23O09044 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Snap23O09044 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Snap23O09044 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Snap23O09044 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Snap23O09044 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Snap23O09044 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Snap23O09044 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Snap23O09044 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Snap23O09044 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Snap23O09044 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Snap23O09044 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Snap23O09044 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Snap23O09044 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Snap23O09044 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Snap23O09044 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Snap23O09044 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Snap23O09044 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Snap23O09044 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Snap23O09044 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Snap23O09044 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Snap23O09044 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Snap23O09044 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Snap23O09044 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Snap23O09044 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Snap23O09044 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Snap23O09044 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Snap23O09044 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Snap23O09044 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Snap23O09044 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Snap23O09044 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Snap23O09044 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Snap23O09044 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Snap23O09044 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Snap23O09044 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Snap23O09044 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Snap23O09044 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Snap23O09044 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snap23O09044 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snap23O09044 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Snap23O09044 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms