Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Dctn1O08788 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dctn1O08788 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Dctn1O08788 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Dctn1O08788 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dctn1O08788 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Dctn1O08788 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dctn1O08788 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dctn1O08788 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dctn1O08788 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dctn1O08788 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dctn1O08788 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dctn1O08788 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dctn1O08788 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dctn1O08788 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dctn1O08788 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dctn1O08788 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dctn1O08788 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dctn1O08788 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dctn1O08788 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dctn1O08788 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dctn1O08788 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dctn1O08788 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dctn1O08788 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dctn1O08788 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dctn1O08788 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dctn1O08788 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms