Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcof1O08784 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcof1O08784 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
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