Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Barx2O08686 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Barx2O08686 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Barx2O08686 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Barx2O08686 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Barx2O08686 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Barx2O08686 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Barx2O08686 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Barx2O08686 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Barx2O08686 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms