Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Efna3O08545 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Efna3O08545 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Efna3O08545 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Efna3O08545 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Efna3O08545 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efna3O08545 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efna3O08545 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efna3O08545 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Efna3O08545 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Efna3O08545 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efna3O08545 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Efna3O08545 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms