Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Gm379J3QQ19 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Gm379J3QQ19 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm379J3QQ19 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm379J3QQ19 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm379J3QQ19 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Gm379J3QQ19 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm379J3QQ19 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm379J3QQ19 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Gm379J3QQ19 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm379J3QQ19 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm379J3QQ19 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm379J3QQ19 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm379J3QQ19 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Gm379J3QQ19 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Gm379J3QQ19 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Gm379J3QQ19 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm379J3QQ19 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms