Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX0

5730507C01Rik, RIKEN cDNA 5730507C01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730507C01RikJ3QPX0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
5730507C01RikJ3QPX0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.33■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.32■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.3■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms