Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccer2J3QPU5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccer2J3QPU5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccer2J3QPU5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccer2J3QPU5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccer2J3QPU5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccer2J3QPU5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccer2J3QPU5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccer2J3QPU5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ccer2J3QPU5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ccer2J3QPU5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Ccer2J3QPU5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ccer2J3QPU5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ccer2J3QPU5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccer2J3QPU5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccer2J3QPU5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccer2J3QPU5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccer2J3QPU5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccer2J3QPU5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccer2J3QPU5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccer2J3QPU5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccer2J3QPU5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccer2J3QPU5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccer2J3QPU5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccer2J3QPU5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccer2J3QPU5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccer2J3QPU5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccer2J3QPU5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccer2J3QPU5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccer2J3QPU5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccer2J3QPU5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccer2J3QPU5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccer2J3QPU5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccer2J3QPU5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccer2J3QPU5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccer2J3QPU5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccer2J3QPU5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccer2J3QPU5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Ccer2J3QPU5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms