Protein–RNA interactions for Protein: J3QP07

B020004C17Rik, RIKEN cDNA B020004C17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020004C17RikJ3QP07 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B020004C17RikJ3QP07 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B020004C17RikJ3QP07 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B020004C17RikJ3QP07 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B020004C17RikJ3QP07 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B020004C17RikJ3QP07 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B020004C17RikJ3QP07 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B020004C17RikJ3QP07 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B020004C17RikJ3QP07 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B020004C17RikJ3QP07 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B020004C17RikJ3QP07 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B020004C17RikJ3QP07 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B020004C17RikJ3QP07 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
B020004C17RikJ3QP07 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
B020004C17RikJ3QP07 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
B020004C17RikJ3QP07 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
B020004C17RikJ3QP07 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
B020004C17RikJ3QP07 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B020004C17RikJ3QP07 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B020004C17RikJ3QP07 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B020004C17RikJ3QP07 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
B020004C17RikJ3QP07 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B020004C17RikJ3QP07 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
B020004C17RikJ3QP07 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms