Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21818J3KMS6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21818J3KMS6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm21818J3KMS6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21818J3KMS6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21818J3KMS6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21818J3KMS6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21818J3KMS6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21818J3KMS6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21818J3KMS6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21818J3KMS6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21818J3KMS6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21818J3KMS6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21818J3KMS6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21818J3KMS6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21818J3KMS6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21818J3KMS6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms