Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20830J3KML6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20830J3KML6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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