Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zfp408H7BX78 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp408H7BX78 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms