Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r58G3X9U3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms