Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zc3h12bG3X9I7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zc3h12bG3X9I7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms