Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sh3tc1G3X9F6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sh3tc1G3X9F6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sh3tc1G3X9F6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sh3tc1G3X9F6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sh3tc1G3X9F6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sh3tc1G3X9F6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh3tc1G3X9F6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh3tc1G3X9F6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh3tc1G3X9F6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh3tc1G3X9F6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh3tc1G3X9F6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh3tc1G3X9F6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh3tc1G3X9F6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh3tc1G3X9F6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh3tc1G3X9F6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh3tc1G3X9F6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh3tc1G3X9F6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sh3tc1G3X9F6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sh3tc1G3X9F6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sh3tc1G3X9F6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sh3tc1G3X9F6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sh3tc1G3X9F6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sh3tc1G3X9F6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sh3tc1G3X9F6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sh3tc1G3X9F6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sh3tc1G3X9F6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sh3tc1G3X9F6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Sh3tc1G3X9F6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sh3tc1G3X9F6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sh3tc1G3X9F6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sh3tc1G3X9F6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sh3tc1G3X9F6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sh3tc1G3X9F6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sh3tc1G3X9F6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sh3tc1G3X9F6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sh3tc1G3X9F6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sh3tc1G3X9F6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sh3tc1G3X9F6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms