Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc9a3G3X939 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9a3G3X939 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc9a3G3X939 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc9a3G3X939 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc9a3G3X939 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc9a3G3X939 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc9a3G3X939 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc9a3G3X939 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc9a3G3X939 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc9a3G3X939 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms