Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U2

1700067P10Rik, RIKEN cDNA 1700067P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700067P10RikG3X8U2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700067P10RikG3X8U2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700067P10RikG3X8U2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700067P10RikG3X8U2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
1700067P10RikG3X8U2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700067P10RikG3X8U2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700067P10RikG3X8U2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
1700067P10RikG3X8U2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700067P10RikG3X8U2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700067P10RikG3X8U2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700067P10RikG3X8U2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700067P10RikG3X8U2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700067P10RikG3X8U2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700067P10RikG3X8U2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700067P10RikG3X8U2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700067P10RikG3X8U2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700067P10RikG3X8U2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700067P10RikG3X8U2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700067P10RikG3X8U2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700067P10RikG3X8U2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700067P10RikG3X8U2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700067P10RikG3X8U2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700067P10RikG3X8U2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700067P10RikG3X8U2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700067P10RikG3X8U2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700067P10RikG3X8U2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms