Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Speer4cG3UXD1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Speer4cG3UXD1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms