Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nkx1-1G3UXB3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nkx1-1G3UXB3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms