Protein–RNA interactions for Protein: G3UW87

Gm17455, MCG55969, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17455G3UW87 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17455G3UW87 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm17455G3UW87 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms