Protein–RNA interactions for Protein: G3UW78

Cyp4f17, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 17, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f17G3UW78 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp4f17G3UW78 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp4f17G3UW78 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp4f17G3UW78 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp4f17G3UW78 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp4f17G3UW78 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp4f17G3UW78 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp4f17G3UW78 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp4f17G3UW78 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp4f17G3UW78 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f17G3UW78 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cyp4f17G3UW78 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms