Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Susd5G3UW60 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Susd5G3UW60 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms