Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
LctF8VPT3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms