Protein–RNA interactions for Protein: F7CD45

Gm8334, Predicted gene 8334, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8334F7CD45 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8334F7CD45 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8334F7CD45 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8334F7CD45 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8334F7CD45 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8334F7CD45 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8334F7CD45 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8334F7CD45 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8334F7CD45 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8334F7CD45 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8334F7CD45 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8334F7CD45 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8334F7CD45 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8334F7CD45 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8334F7CD45 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8334F7CD45 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8334F7CD45 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8334F7CD45 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm8334F7CD45 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm8334F7CD45 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm8334F7CD45 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm8334F7CD45 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm8334F7CD45 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm8334F7CD45 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8334F7CD45 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm8334F7CD45 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms