Protein–RNA interactions for Protein: F7BCK0

Dcdc2b, Doublecortin domain-containing 2b (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcdc2bF7BCK0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dcdc2bF7BCK0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dcdc2bF7BCK0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dcdc2bF7BCK0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dcdc2bF7BCK0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dcdc2bF7BCK0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dcdc2bF7BCK0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dcdc2bF7BCK0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dcdc2bF7BCK0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dcdc2bF7BCK0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dcdc2bF7BCK0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dcdc2bF7BCK0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dcdc2bF7BCK0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dcdc2bF7BCK0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dcdc2bF7BCK0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dcdc2bF7BCK0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dcdc2bF7BCK0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dcdc2bF7BCK0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dcdc2bF7BCK0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dcdc2bF7BCK0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dcdc2bF7BCK0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Dcdc2bF7BCK0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dcdc2bF7BCK0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dcdc2bF7BCK0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dcdc2bF7BCK0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dcdc2bF7BCK0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dcdc2bF7BCK0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dcdc2bF7BCK0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dcdc2bF7BCK0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dcdc2bF7BCK0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dcdc2bF7BCK0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dcdc2bF7BCK0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dcdc2bF7BCK0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dcdc2bF7BCK0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dcdc2bF7BCK0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dcdc2bF7BCK0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dcdc2bF7BCK0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dcdc2bF7BCK0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dcdc2bF7BCK0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Dcdc2bF7BCK0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms