Protein–RNA interactions for Protein: F6Z6Z2

3110082J24Rik, RIKEN cDNA 3110082J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110082J24RikF6Z6Z2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
3110082J24RikF6Z6Z2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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