Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10378F6XQQ1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm10378F6XQQ1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
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