Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8247F6VRJ8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8247F6VRJ8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms