Protein–RNA interactions for Protein: F6R5P4

Ccl17, C-C motif chemokine, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl17F6R5P4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl17F6R5P4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl17F6R5P4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms