Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Erich3F6QRE9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Erich3F6QRE9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Erich3F6QRE9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Erich3F6QRE9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Erich3F6QRE9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Erich3F6QRE9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Erich3F6QRE9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Erich3F6QRE9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Erich3F6QRE9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Erich3F6QRE9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Erich3F6QRE9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Erich3F6QRE9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Erich3F6QRE9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Erich3F6QRE9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Erich3F6QRE9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Erich3F6QRE9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Erich3F6QRE9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Erich3F6QRE9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Erich3F6QRE9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Erich3F6QRE9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Erich3F6QRE9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Erich3F6QRE9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Erich3F6QRE9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Erich3F6QRE9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Erich3F6QRE9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Erich3F6QRE9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Erich3F6QRE9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Erich3F6QRE9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Erich3F6QRE9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Erich3F6QRE9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Erich3F6QRE9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Erich3F6QRE9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Erich3F6QRE9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Erich3F6QRE9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Erich3F6QRE9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Erich3F6QRE9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms