Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Rnf165E9QAU8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Rnf165E9QAU8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Rnf165E9QAU8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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Rnf165E9QAU8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
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Rnf165E9QAU8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Rnf165E9QAU8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Rnf165E9QAU8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf165E9QAU8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf165E9QAU8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf165E9QAU8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf165E9QAU8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf165E9QAU8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf165E9QAU8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf165E9QAU8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf165E9QAU8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf165E9QAU8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf165E9QAU8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf165E9QAU8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf165E9QAU8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf165E9QAU8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf165E9QAU8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf165E9QAU8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf165E9QAU8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf165E9QAU8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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