Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cald1E9QA15 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cald1E9QA15 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Cald1E9QA15 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cald1E9QA15 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cald1E9QA15 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cald1E9QA15 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cald1E9QA15 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cald1E9QA15 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cald1E9QA15 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cald1E9QA15 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cald1E9QA15 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cald1E9QA15 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cald1E9QA15 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cald1E9QA15 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cald1E9QA15 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cald1E9QA15 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cald1E9QA15 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cald1E9QA15 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cald1E9QA15 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cald1E9QA15 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cald1E9QA15 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cald1E9QA15 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cald1E9QA15 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cald1E9QA15 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cald1E9QA15 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Cald1E9QA15 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cald1E9QA15 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cald1E9QA15 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cald1E9QA15 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cald1E9QA15 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cald1E9QA15 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cald1E9QA15 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Cald1E9QA15 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Cald1E9QA15 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cald1E9QA15 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cald1E9QA15 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cald1E9QA15 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cald1E9QA15 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cald1E9QA15 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cald1E9QA15 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms