Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
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Ccdc7bE9Q9Y3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
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Ccdc7bE9Q9Y3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc7bE9Q9Y3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Ccdc7bE9Q9Y3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Ccdc7bE9Q9Y3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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