Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzd7E9Q9W7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzd7E9Q9W7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzd7E9Q9W7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzd7E9Q9W7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzd7E9Q9W7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzd7E9Q9W7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzd7E9Q9W7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzd7E9Q9W7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzd7E9Q9W7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzd7E9Q9W7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzd7E9Q9W7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzd7E9Q9W7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzd7E9Q9W7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzd7E9Q9W7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzd7E9Q9W7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzd7E9Q9W7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzd7E9Q9W7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzd7E9Q9W7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzd7E9Q9W7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdzd7E9Q9W7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzd7E9Q9W7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdzd7E9Q9W7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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