Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9S5

Gm9964, Predicted gene 9964, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9964E9Q9S5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gm9964E9Q9S5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Gm9964E9Q9S5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm9964E9Q9S5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm9964E9Q9S5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm9964E9Q9S5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm9964E9Q9S5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm9964E9Q9S5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm9964E9Q9S5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm9964E9Q9S5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm9964E9Q9S5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm9964E9Q9S5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm9964E9Q9S5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm9964E9Q9S5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm9964E9Q9S5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm9964E9Q9S5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm9964E9Q9S5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm9964E9Q9S5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm9964E9Q9S5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm9964E9Q9S5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm9964E9Q9S5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm9964E9Q9S5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm9964E9Q9S5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm9964E9Q9S5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm9964E9Q9S5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm9964E9Q9S5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm9964E9Q9S5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gm9964E9Q9S5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm9964E9Q9S5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gm9964E9Q9S5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm9964E9Q9S5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm9964E9Q9S5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm9964E9Q9S5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm9964E9Q9S5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm9964E9Q9S5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm9964E9Q9S5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm9964E9Q9S5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm9964E9Q9S5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm9964E9Q9S5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm9964E9Q9S5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm9964E9Q9S5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm9964E9Q9S5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm9964E9Q9S5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm9964E9Q9S5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm9964E9Q9S5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm9964E9Q9S5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm9964E9Q9S5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm9964E9Q9S5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm9964E9Q9S5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms