Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Y4

A430078G23Rik, RIKEN cDNA A430078G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430078G23RikE9Q7Y4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A430078G23RikE9Q7Y4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A430078G23RikE9Q7Y4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms