Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc85cE9Q6B2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc85cE9Q6B2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc85cE9Q6B2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc85cE9Q6B2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc85cE9Q6B2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc85cE9Q6B2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc85cE9Q6B2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc85cE9Q6B2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc85cE9Q6B2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc85cE9Q6B2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc85cE9Q6B2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc85cE9Q6B2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc85cE9Q6B2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc85cE9Q6B2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc85cE9Q6B2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc85cE9Q6B2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc85cE9Q6B2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc85cE9Q6B2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc85cE9Q6B2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc85cE9Q6B2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.4 ms