Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtproE9Q612 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtproE9Q612 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtproE9Q612 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtproE9Q612 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtproE9Q612 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtproE9Q612 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtproE9Q612 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtproE9Q612 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtproE9Q612 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtproE9Q612 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtproE9Q612 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtproE9Q612 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PtproE9Q612 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 232.9 ms