Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ythdc1E9Q5K9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms