Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BC005561E9Q5E2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
BC005561E9Q5E2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
BC005561E9Q5E2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
BC005561E9Q5E2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
BC005561E9Q5E2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
BC005561E9Q5E2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
BC005561E9Q5E2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
BC005561E9Q5E2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
BC005561E9Q5E2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
BC005561E9Q5E2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
BC005561E9Q5E2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
BC005561E9Q5E2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
BC005561E9Q5E2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
BC005561E9Q5E2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
BC005561E9Q5E2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
BC005561E9Q5E2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
BC005561E9Q5E2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
BC005561E9Q5E2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
BC005561E9Q5E2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
BC005561E9Q5E2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
BC005561E9Q5E2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
BC005561E9Q5E2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
BC005561E9Q5E2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
BC005561E9Q5E2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
BC005561E9Q5E2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
BC005561E9Q5E2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BC005561E9Q5E2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
BC005561E9Q5E2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
BC005561E9Q5E2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
BC005561E9Q5E2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
BC005561E9Q5E2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
BC005561E9Q5E2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
BC005561E9Q5E2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BC005561E9Q5E2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BC005561E9Q5E2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
BC005561E9Q5E2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
BC005561E9Q5E2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
BC005561E9Q5E2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
BC005561E9Q5E2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
BC005561E9Q5E2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
BC005561E9Q5E2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
BC005561E9Q5E2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
BC005561E9Q5E2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
BC005561E9Q5E2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
BC005561E9Q5E2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BC005561E9Q5E2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
BC005561E9Q5E2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
BC005561E9Q5E2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BC005561E9Q5E2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BC005561E9Q5E2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
BC005561E9Q5E2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BC005561E9Q5E2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
BC005561E9Q5E2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
BC005561E9Q5E2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
BC005561E9Q5E2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
BC005561E9Q5E2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
BC005561E9Q5E2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
BC005561E9Q5E2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
BC005561E9Q5E2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
BC005561E9Q5E2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
BC005561E9Q5E2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
BC005561E9Q5E2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
BC005561E9Q5E2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
BC005561E9Q5E2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms