Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trip11E9Q512 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trip11E9Q512 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip11E9Q512 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trip11E9Q512 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms