Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4E0

5031410I06Rik, RIKEN cDNA 5031410I06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5031410I06RikE9Q4E0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.53■■■□□ 2
5031410I06RikE9Q4E0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
5031410I06RikE9Q4E0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
5031410I06RikE9Q4E0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
5031410I06RikE9Q4E0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
5031410I06RikE9Q4E0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
5031410I06RikE9Q4E0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.52■■■□□ 2
5031410I06RikE9Q4E0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.52■■■□□ 2
5031410I06RikE9Q4E0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
5031410I06RikE9Q4E0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
5031410I06RikE9Q4E0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
5031410I06RikE9Q4E0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
5031410I06RikE9Q4E0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms