Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3G8

Nup153, Nucleoporin 153, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup153E9Q3G8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup153E9Q3G8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nup153E9Q3G8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nup153E9Q3G8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nup153E9Q3G8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nup153E9Q3G8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup153E9Q3G8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms