Protein–RNA interactions for Protein: E9Q355

Catsperg1, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg1E9Q355 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Catsperg1E9Q355 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Catsperg1E9Q355 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Catsperg1E9Q355 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Catsperg1E9Q355 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Catsperg1E9Q355 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Catsperg1E9Q355 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Catsperg1E9Q355 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Catsperg1E9Q355 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Catsperg1E9Q355 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Catsperg1E9Q355 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Catsperg1E9Q355 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Catsperg1E9Q355 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Catsperg1E9Q355 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Catsperg1E9Q355 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Catsperg1E9Q355 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Catsperg1E9Q355 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Catsperg1E9Q355 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Catsperg1E9Q355 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Catsperg1E9Q355 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Catsperg1E9Q355 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Catsperg1E9Q355 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Catsperg1E9Q355 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Catsperg1E9Q355 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Catsperg1E9Q355 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Catsperg1E9Q355 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms